Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECM29Q5VYK3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM29Q5VYK3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms