Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRCH2Q5VUJ6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms