Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC158Q5M9N0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC158Q5M9N0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms