Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC93Q567U6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC93Q567U6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms