Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL12Q53G59 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL12Q53G59 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms