Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBW0

NBPF9, Neuroblastoma breakpoint family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF9Q3BBW0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NBPF9Q3BBW0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF9Q3BBW0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms