Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC96Q2M329 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms