Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDO1Q16878 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDO1Q16878 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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