Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA4Q16363 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA4Q16363 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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