Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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