Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TLR1Q15399 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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