Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LAPTM4AQ15012 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LAPTM4AQ15012 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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