Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NWD1Q149M9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms