Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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