Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSC3Q14574 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DSC3Q14574 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms