Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARF1Q14162 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARF1Q14162 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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