Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTR4Q13639 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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