Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRF5Q13568 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IRF5Q13568 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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