Protein–RNA interactions for Protein: Q13506

NAB1, NGFI-A-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAB1Q13506 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NAB1Q13506 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NAB1Q13506 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms