Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PICALMQ13492 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PICALMQ13492 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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