Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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PTPRSQ13332 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRSQ13332 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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