Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STRN3Q13033 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms