Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMARCB1Q12824 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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