Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TROQ12816 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TROQ12816 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TROQ12816 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TROQ12816 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TROQ12816 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TROQ12816 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TROQ12816 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TROQ12816 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TROQ12816 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TROQ12816 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TROQ12816 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TROQ12816 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TROQ12816 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TROQ12816 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TROQ12816 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TROQ12816 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TROQ12816 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TROQ12816 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TROQ12816 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TROQ12816 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TROQ12816 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TROQ12816 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TROQ12816 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TROQ12816 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TROQ12816 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TROQ12816 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TROQ12816 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TROQ12816 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TROQ12816 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TROQ12816 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TROQ12816 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TROQ12816 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TROQ12816 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TROQ12816 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TROQ12816 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TROQ12816 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TROQ12816 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
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