Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GOLGA3Q08378 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GOLGA3Q08378 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GOLGA3Q08378 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GOLGA3Q08378 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GOLGA3Q08378 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GOLGA3Q08378 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GOLGA3Q08378 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GOLGA3Q08378 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GOLGA3Q08378 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GOLGA3Q08378 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GOLGA3Q08378 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GOLGA3Q08378 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GOLGA3Q08378 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms