Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCN1BQ07699 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms