Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FMODQ06828 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FMODQ06828 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FMODQ06828 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms