Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALD1Q05682 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALD1Q05682 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms