Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EMX2Q04743 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms