Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 KRTAP4-1-201ENST00000398472 1241 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 KRTAP4-1-202ENST00000620667 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNB1Q02641 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms