Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLTCQ00610 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms