Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCL7P80098 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCL7P80098 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCL7P80098 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCL7P80098 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCL7P80098 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCL7P80098 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCL7P80098 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCL7P80098 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCL7P80098 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCL7P80098 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCL7P80098 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL7P80098 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL7P80098 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL7P80098 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL7P80098 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL7P80098 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL7P80098 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL7P80098 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL7P80098 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL7P80098 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL7P80098 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL7P80098 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL7P80098 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL7P80098 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL7P80098 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL7P80098 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL7P80098 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL7P80098 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms