Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIP4K2BP78356 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms