Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GNB1P62873 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNB1P62873 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms