Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LINC01547P58512 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms