Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIK1P57059 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIK1P57059 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK1P57059 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK1P57059 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK1P57059 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK1P57059 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK1P57059 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK1P57059 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK1P57059 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK1P57059 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK1P57059 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK1P57059 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK1P57059 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIK1P57059 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIK1P57059 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIK1P57059 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SIK1P57059 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIK1P57059 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK1P57059 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK1P57059 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK1P57059 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK1P57059 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK1P57059 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK1P57059 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK1P57059 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK1P57059 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK1P57059 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK1P57059 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK1P57059 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK1P57059 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK1P57059 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK1P57059 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK1P57059 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK1P57059 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SIK1P57059 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK1P57059 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK1P57059 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK1P57059 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK1P57059 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK1P57059 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SIK1P57059 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms