Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP7P55210 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP7P55210 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP7P55210 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP7P55210 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASP7P55210 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP7P55210 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP7P55210 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP7P55210 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP7P55210 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP7P55210 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP7P55210 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP7P55210 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP7P55210 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP7P55210 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP7P55210 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP7P55210 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP7P55210 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP7P55210 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP7P55210 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP7P55210 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP7P55210 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms