Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms