Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA2D1P54289 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms