Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP98P52948 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP98P52948 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP98P52948 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP98P52948 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP98P52948 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP98P52948 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP98P52948 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP98P52948 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP98P52948 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP98P52948 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP98P52948 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP98P52948 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP98P52948 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP98P52948 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP98P52948 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP98P52948 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP98P52948 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP98P52948 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP98P52948 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP98P52948 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP98P52948 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP98P52948 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP98P52948 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP98P52948 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP98P52948 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP98P52948 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP98P52948 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP98P52948 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP98P52948 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP98P52948 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP98P52948 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP98P52948 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP98P52948 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP98P52948 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP98P52948 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP98P52948 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP98P52948 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP98P52948 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP98P52948 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP98P52948 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP98P52948 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP98P52948 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP98P52948 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP98P52948 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP98P52948 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP98P52948 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP98P52948 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP98P52948 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms