Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LUMP51884 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LUMP51884 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LUMP51884 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LUMP51884 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LUMP51884 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LUMP51884 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LUMP51884 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LUMP51884 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LUMP51884 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LUMP51884 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LUMP51884 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LUMP51884 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LUMP51884 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LUMP51884 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LUMP51884 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
LUMP51884 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LUMP51884 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LUMP51884 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LUMP51884 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LUMP51884 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LUMP51884 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LUMP51884 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LUMP51884 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LUMP51884 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LUMP51884 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms