Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT3P49368 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT3P49368 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT3P49368 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT3P49368 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT3P49368 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCT3P49368 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCT3P49368 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCT3P49368 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT3P49368 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT3P49368 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT3P49368 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT3P49368 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT3P49368 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT3P49368 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT3P49368 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT3P49368 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT3P49368 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT3P49368 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT3P49368 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCT3P49368 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCT3P49368 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCT3P49368 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCT3P49368 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCT3P49368 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCT3P49368 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCT3P49368 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCT3P49368 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCT3P49368 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms