Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNTBP49356 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTBP49356 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTBP49356 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTBP49356 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTBP49356 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTBP49356 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTBP49356 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTBP49356 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTBP49356 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTBP49356 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTBP49356 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTBP49356 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTBP49356 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTBP49356 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTBP49356 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTBP49356 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTBP49356 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTBP49356 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTBP49356 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTBP49356 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTBP49356 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTBP49356 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTBP49356 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTBP49356 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTBP49356 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTBP49356 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTBP49356 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTBP49356 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTBP49356 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTBP49356 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms