Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NESP48681 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NESP48681 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NESP48681 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NESP48681 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NESP48681 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NESP48681 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NESP48681 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NESP48681 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NESP48681 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NESP48681 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NESP48681 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NESP48681 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
NESP48681 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NESP48681 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NESP48681 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NESP48681 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NESP48681 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NESP48681 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NESP48681 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
NESP48681 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
NESP48681 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
NESP48681 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NESP48681 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
NESP48681 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
NESP48681 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NESP48681 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
NESP48681 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
NESP48681 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NESP48681 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NESP48681 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NESP48681 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NESP48681 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NESP48681 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NESP48681 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NESP48681 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NESP48681 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NESP48681 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NESP48681 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NESP48681 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
NESP48681 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NESP48681 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NESP48681 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NESP48681 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NESP48681 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NESP48681 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NESP48681 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NESP48681 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NESP48681 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NESP48681 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NESP48681 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NESP48681 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NESP48681 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NESP48681 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NESP48681 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NESP48681 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NESP48681 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NESP48681 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NESP48681 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NESP48681 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NESP48681 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NESP48681 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NESP48681 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NESP48681 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NESP48681 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NESP48681 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NESP48681 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NESP48681 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NESP48681 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
NESP48681 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NESP48681 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NESP48681 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NESP48681 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NESP48681 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
NESP48681 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NESP48681 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NESP48681 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NESP48681 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NESP48681 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NESP48681 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NESP48681 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NESP48681 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NESP48681 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NESP48681 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NESP48681 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NESP48681 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NESP48681 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NESP48681 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NESP48681 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NESP48681 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
NESP48681 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NESP48681 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NESP48681 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NESP48681 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms