Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME1P48163 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ME1P48163 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME1P48163 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME1P48163 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME1P48163 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME1P48163 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME1P48163 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME1P48163 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME1P48163 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME1P48163 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME1P48163 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME1P48163 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME1P48163 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME1P48163 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME1P48163 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME1P48163 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ME1P48163 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME1P48163 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME1P48163 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME1P48163 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME1P48163 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ME1P48163 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME1P48163 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME1P48163 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME1P48163 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME1P48163 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME1P48163 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME1P48163 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME1P48163 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME1P48163 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME1P48163 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME1P48163 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ME1P48163 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME1P48163 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ME1P48163 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ME1P48163 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ME1P48163 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms