Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UTRNP46939 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UTRNP46939 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UTRNP46939 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UTRNP46939 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UTRNP46939 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UTRNP46939 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UTRNP46939 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UTRNP46939 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTRNP46939 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTRNP46939 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTRNP46939 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTRNP46939 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTRNP46939 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTRNP46939 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTRNP46939 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UTRNP46939 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTRNP46939 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTRNP46939 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTRNP46939 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTRNP46939 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTRNP46939 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTRNP46939 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTRNP46939 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UTRNP46939 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UTRNP46939 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UTRNP46939 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UTRNP46939 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UTRNP46939 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UTRNP46939 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms