Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMPOP42166 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPOP42166 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPOP42166 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPOP42166 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPOP42166 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPOP42166 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPOP42166 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPOP42166 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPOP42166 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPOP42166 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMPOP42166 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMPOP42166 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMPOP42166 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMPOP42166 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMPOP42166 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMPOP42166 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMPOP42166 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMPOP42166 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMPOP42166 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMPOP42166 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMPOP42166 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMPOP42166 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMPOP42166 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMPOP42166 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMPOP42166 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPOP42166 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPOP42166 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPOP42166 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPOP42166 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPOP42166 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPOP42166 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPOP42166 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPOP42166 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPOP42166 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPOP42166 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPOP42166 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPOP42166 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPOP42166 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPOP42166 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPOP42166 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPOP42166 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPOP42166 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPOP42166 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPOP42166 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPOP42166 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPOP42166 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPOP42166 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPOP42166 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPOP42166 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPOP42166 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPOP42166 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPOP42166 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPOP42166 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPOP42166 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMPOP42166 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms