Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BMI1P35226 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BMI1P35226 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BMI1P35226 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BMI1P35226 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BMI1P35226 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms