Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKARP32238 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKARP32238 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKARP32238 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 376.7 ms