Protein–RNA interactions for Protein: P31937

HIBADH, 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIBADHP31937 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIBADHP31937 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIBADHP31937 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms